1. 在二审程序中，当事人申请撤回上诉并不一定会被准许。撤回上诉需要经过审判机关的同意，也就是说审判机关对申请撤回上诉有不准许的权利。

2. 当事人在二审程序中申请撤回上诉，审判机关可能会考虑多重因素，例如，是否可能对公共利益或他人合法权益造成严重损害；是否可能影响司法公正和公信力；以及当事人是否有恶意或其他不当行为等等。

3. 如果当事人存在上述情况，审判机关就有权对其申请撤回上诉进行拒绝，并继续进行审理。比如，如果当事人撤诉后再次起诉，或者在其他方面表现出对司法的影响力，申请撤回上诉很可能会被审判机关拒绝。

4. 当然，在某些情况下，申请撤回上诉可能会被准许，例如，当事人在进行二审程序中发现了新的证据或者理由，认为撤回上诉对当事人自身权益更为有利，同时也不会损害社会公共利益等等情况。

5. 总之，审判机关对当事人申请撤回上诉会根据具体情况进行综合评估。当事人提出撤回上诉后，应该充分论证自己的理由和事实，同时遵守法律法规，并积极配合法院审理。